Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCOA3Q9Y6Q9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCOA3Q9Y6Q9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms