Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRXN3Q9Y4C0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRXN3Q9Y4C0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms