Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF408Q9H9D4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF408Q9H9D4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms