Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLIRPQ9GZT3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms