Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssx9Q6XAS3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Ssx9Q6XAS3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Ssx9Q6XAS3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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