Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCSAPQ6IQ19 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCSAPQ6IQ19 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms