Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SvipQ3UZP4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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