Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDSNQ15517 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDSNQ15517 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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