Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTPRSQ13332 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTPRSQ13332 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPRSQ13332 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRSQ13332 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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