Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF6Q13247 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms