Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMAD3P84022 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMAD3P84022 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms