Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HBBP68871 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HBBP68871 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HBBP68871 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HBBP68871 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HBBP68871 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HBBP68871 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
HBBP68871 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HBBP68871 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms