Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A5P29400 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A5P29400 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms