Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms