Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VIL1P09327 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIL1P09327 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIL1P09327 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIL1P09327 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms