Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLRMTO00411 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLRMTO00411 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms