Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALKQ9UM73 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALKQ9UM73 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms