Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INO80Q9ULG1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms