Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF3C4Q9UKN8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF3C4Q9UKN8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms