Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHRF1Q9P1Y6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms