Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HELLSQ9NRZ9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms