Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ASCL3Q9NQ33 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ASCL3Q9NQ33 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms