Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms