Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GpnmbQ99P91 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GpnmbQ99P91 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms