Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRAMP1Q96RY5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms