Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PGBD1Q96JS3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PGBD1Q96JS3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms