Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC178Q5BJE1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC178Q5BJE1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms