Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM9

C1ql4, Complement C1q-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql4Q4ZJM9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C1ql4Q4ZJM9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C1ql4Q4ZJM9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C1ql4Q4ZJM9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C1ql4Q4ZJM9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C1ql4Q4ZJM9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
C1ql4Q4ZJM9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
C1ql4Q4ZJM9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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C1ql4Q4ZJM9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C1ql4Q4ZJM9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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