Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL24A1Q17RW2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL24A1Q17RW2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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