Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCL9Q07325 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms