Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN12Q05209 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN12Q05209 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms