Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIK1P57059 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIK1P57059 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SIK1P57059 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIK1P57059 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SIK1P57059 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms