Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBP2P32456 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBP2P32456 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBP2P32456 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBP2P32456 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBP2P32456 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GBP2P32456 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GBP2P32456 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
GBP2P32456 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GBP2P32456 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GBP2P32456 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms