Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA7P31268 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms