Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA10P31260 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA10P31260 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms