Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LTKP29376 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LTKP29376 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTKP29376 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTKP29376 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTKP29376 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LTKP29376 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LTKP29376 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LTKP29376 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LTKP29376 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTKP29376 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTKP29376 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTKP29376 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTKP29376 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms