Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP1P28562 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUSP1P28562 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms