Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
U2AF1L5P0DN76 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms