Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEFMP07197 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms