Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms