Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
INO80Q9ULG1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INO80Q9ULG1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms