Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP4Q9C0A0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms