Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYCP2Q9BX26 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2Q9BX26 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms