Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FYCO1Q9BQS8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms