Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUP88Q99567 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms