Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALS2Q96Q42 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms