Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SncbQ91ZZ3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SncbQ91ZZ3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms