Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Colec10Q8CF98 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Colec10Q8CF98 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Colec10Q8CF98 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Colec10Q8CF98 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Colec10Q8CF98 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Colec10Q8CF98 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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