Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
OTOP1Q7RTM1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
OTOP1Q7RTM1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms