Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CARMIL2Q6F5E8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CARMIL2Q6F5E8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms